Stjórn EFÍA er skipuð fimm stjórnarmönnum. Þrír stjórnarmenn eru kjörnir af sjóðfélögum til tveggja ára í senn og tveir stjórnarmenn eru tilnefndir af launagreiðendum til eins árs í senn.
Eftirlaunasjóður FÍA leggur mikla áherslu á að mæta samtímaþörfum sjóðfélaga, án þess þó að tefla í hættu framtíðarþörfum komandi kynslóða.
Eftirlaunasjóður félags íslenskra atvinnuflugmanna (EFÍA) er opinn öllum sem taka laun á grundvelli kjarasamnings sem FÍA hefur gert við launagreiðendur.